Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot1Q6ZQ08 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms