Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm29Q6PDI5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm29Q6PDI5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms