Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms