Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms