Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Knl1Q66JQ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Knl1Q66JQ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knl1Q66JQ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms