Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms