Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228bQ497Q6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms