Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkain3Q3URJ8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkain3Q3URJ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkain3Q3URJ8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkain3Q3URJ8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nkain3Q3URJ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nkain3Q3URJ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nkain3Q3URJ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nkain3Q3URJ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nkain3Q3URJ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms