Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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