Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MitfQ08874 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms