Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf9Q07105 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms