Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	COG2	YGR120C	789 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	RPL6A	YML073C	531 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	ADI1	YMR009W	540 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	CSI1	YMR025W	888 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	IRC21	YMR073C	606 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YNL109W	YNL109W	546 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	CSI2	YOL007C	1026 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	RPL11A	YPR102C	525 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	MBA1	YBR185C	837 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	MMS1	YPR164W	4224 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YDR239C	YDR239C	2364 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YIL169C	YIL169C	2988 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	MNT3	YIL014W	1893 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	RPS14A	YCR031C	414 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	PBP4	YDL053C	558 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	NTF2	YER009W	378 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	NSA2	YER126C	786 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	SRL3	YKR091W	741 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YNL235C	YNL235C	432 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YOL029C	YOL029C	606 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	SGT1	YOR057W	1188 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YPR170C	YPR170C	336 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YBR259W	YBR259W	2067 nt		2.86	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	GEA1	YJR031C	4227 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	CSF1	YLR087C	8877 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	TMA20	YER007C-A	546 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	PRP38	YGR075C	729 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	COX23	YHR116W	456 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YJL169W	YJL169W	369 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	ASG7	YJL170C	630 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	ECM9	YKR004C	1134 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YLR076C	YLR076C	423 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YPL142C	YPL142C	318 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	VHR1	YIL056W	1923 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	CWH41	YGL027C	2502 nt		2.85	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	STI1	YOR027W	1770 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	PDS5	YMR076C	3834 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	DSE4	YNR067C	3354 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	HEH2	YDR458C	1992 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	SNA4	YDL123W	423 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	DTD1	YDL219W	453 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	OCA6	YDR067C	675 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	EFG1	YGR271C-A	702 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	PPX1	YHR201C	1194 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	SFT1	YKL006C-A	294 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	ATG38	YLR211C	681 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	PAI3	YMR174C	207 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	ACM1	YPL267W	630 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	MUD1	YBR119W	897 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	SEC66	YBR171W	621 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	snR42	snR42	351 nt		2.84	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	STN1	YDR082W	1485 nt		2.84	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	ASI3	YNL008C	2031 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	RGC1	YPR115W	3252 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	HYP2	YEL034W	474 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	MIC19	YFR011C	513 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	PEX18	YHR160C	852 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	NTC20	YBR188C	423 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	Q0017	Q0017	162 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	ECM21	YBL101C	3354 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YDR461C-A	YDR461C-A	243 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YGL152C	YGL152C	678 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YJR087W	YJR087W	351 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YLR297W	YLR297W	390 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YBR051W	YBR051W	351 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	RIM13	YMR154C	2184 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	ICR1	ICR1	3199 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	FMP32	YFL046W	624 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	RPL23A	YBL087C	414 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	MRPL40	YPL173W	894 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	URB2	YJR041C	3525 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	HOP1	YIL072W	1818 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	UBX3	YDL091C	1368 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	RRT13	YER066W	558 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YGR017W	YGR017W	894 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	CKA1	YIL035C	1119 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	SYS1	YJL004C	612 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	MRPL38	YKL170W	417 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	VPS63	YLR261C	327 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	VMA6	YLR447C	1038 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	RPL16B	YNL069C	597 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	MIX23	YBL107C	591 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	TIM12	YBR091C	330 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	AI2	Q0055	2565 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YJL132W	YJL132W	2253 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YKU80	YMR106C	1890 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	STE23	YLR389C	3084 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	SHS1	YDL225W	1656 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YLR001C	YLR001C	2589 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	MAK5	YBR142W	2322 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	MFB1	YDR219C	1398 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	snR5	snR5	204 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	FAR7	YFR008W	666 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YHR213W	YHR213W	597 nt		2.79	□□□□□ -1.96

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