Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm5cP41230 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Kdm5cP41230 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5cP41230 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5cP41230 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5cP41230 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5cP41230 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5cP41230 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5cP41230 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5cP41230 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5cP41230 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms