Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf5O35326 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms