Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms