Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms