Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms