Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg2C6KI89 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg2C6KI89 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms