Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms