Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.4 ms