Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SETD1BQ9UPS6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms