Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms