Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col5a3Q9JLI2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms