Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms