Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms