Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ophn1Q99J31 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ophn1Q99J31 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms