Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM43Q96BQ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms