Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit1Q8K099 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit1Q8K099 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms