Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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