Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC62Q6P9F0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms