Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
U2surpQ6NV83 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms