Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brf2Q3UAW9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brf2Q3UAW9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms