Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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