Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp444Q3TDV8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp444Q3TDV8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp444Q3TDV8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp444Q3TDV8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp444Q3TDV8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms