Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 MCT1YOR221C 1083 nt1.96□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 AFI1YOR129C 2682 nt1.96□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 UTP20YBL004W 7482 nt1.95□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 DBP5YOR046C 1449 nt1.95□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 TOM70YNL121C 1854 nt1.95□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 MPD2YOL088C 834 nt1.95□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 YCK2YNL154C 1641 nt1.94□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 HRI1YLR301W 735 nt1.94□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 YOR029WYOR029W 336 nt1.94□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 TPO5YKL174C 1857 nt1.94□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 SIP4YJL089W 2490 nt1.94□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 KCS1YDR017C 3153 nt1.94□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 AGE1YDR524C 1449 nt1.94□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 OST1YJL002C 1431 nt1.94□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 GRX3YDR098C 858 nt1.93□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 YGL069CYGL069C 465 nt1.93□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.93□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 EAF7YNL136W 1278 nt1.93□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 MAD1YGL086W 2250 nt1.93□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 GEA2YEL022W 4380 nt1.93□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 SHE9YDR393W 1371 nt1.92□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 YJL015CYJL015C 285 nt1.92□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 IBA57YJR122W 1494 nt1.92□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 YGL117WYGL117W 798 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 CNS1YBR155W 1158 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 SLM1YIL105C 2061 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 PLC1YPL268W 2610 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 NEM1YHR004C 1341 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 YLR422WYLR422W 5799 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 RLI1YDR091C 1827 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 SNL1YIL016W 480 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 SVS1YPL163C 783 nt1.91□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 STP1YDR463W 1560 nt1.9□□□□□ -2.1
SMC4Q12267 INP51YIL002C 2841 nt1.9□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 NPR1YNL183C 2373 nt1.9□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 QCR9YGR183C 201 nt1.9□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 EST3YIL009C-A 546 nt1.9□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 CTP1YBR291C 900 nt1.9□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 NDC80YIL144W 2076 nt1.9□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.89□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.89□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 PLP1YDR183W 693 nt1.88□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 BUR6YER159C 429 nt1.88□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 YER067C-AYER067C-A 324 nt1.87□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.87□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.87□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt1.87□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 RPS29AYLR388W 171 nt1.87□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 SLM4YBR077C 489 nt1.87□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 DSE4YNR067C 3354 nt1.87□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 VPS54YDR027C 2670 nt1.87□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 MIC60YKR016W 1623 nt1.87□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 YMR045CYMR045C 5268 nt1.86□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt1.86□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 ARG2YJL071W 1725 nt1.86□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 PEX14YGL153W 1026 nt1.85□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 YGR111WYGR111W 1203 nt1.85□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 YBR174CYBR174C 315 nt1.85□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 TCM62YBR044C 1719 nt1.85□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 VPS38YLR360W 1320 nt1.85□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 RKM1YPL208W 1752 nt1.85□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 HOP1YIL072W 1818 nt1.85□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 DFG16YOR030W 1860 nt1.85□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 CTH1YDR151C 978 nt1.84□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 BUR2YLR226W 1188 nt1.84□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 snR3snR3 194 nt1.84□□□□□ -2.11
SMC4Q12267 MDM32YOR147W 1869 nt1.84□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 SPP382YLR424W 2127 nt1.84□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 RPL33BYOR234C 324 nt1.83□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 YPK3YBR028C 1578 nt1.83□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 CIK1YMR198W 1785 nt1.83□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 TIM9YEL020W-A 264 nt1.83□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 MSL1YIR009W 336 nt1.83□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 CNM67YNL225C 1746 nt1.82□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 MCM21YDR318W 1107 nt1.82□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 YER085CYER085C 522 nt1.82□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 YGR242WYGR242W 309 nt1.82□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 INA22YIR024C 651 nt1.82□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 CDC25YLR310C 4770 nt1.82□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 MRE11YMR224C 2079 nt1.81□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 UFD2YDL190C 2886 nt1.81□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 NUP157YER105C 4176 nt1.81□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 YJR061WYJR061W 2808 nt1.81□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.81□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 INP1YMR204C 1263 nt1.81□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 REG1YDR028C 3045 nt1.81□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 PET309YLR067C 2898 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 RPS0BYLR048W 759 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 SPH1YLR313C 1593 nt1.8□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 VMR1YHL035C 4779 nt1.79□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt1.79□□□□□ -2.12
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