Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms