Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2mP61082 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2mP61082 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms