Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Kdm2aP59997 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm2aP59997 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms