Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	MND1	YGL183C	660 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	NTO1	YPR031W	2247 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	AVT5	YBL089W	1380 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SYO1	YDL063C	1863 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	MUS81	YDR386W	1899 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	BNR1	YIL159W	4128 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	RED1	YLR263W	2484 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	CDC20	YGL116W	1833 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	ESC1	YMR219W	4977 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	NOP12	YOL041C	1380 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	EMI1	YDR512C	564 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SDS22	YKL193C	1017 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YPL107W	YPL107W	747 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	BRE5	YNR051C	1548 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	VPS3	YDR495C	3036 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YCR013C	YCR013C	648 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SLD5	YDR489W	885 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	VEL1	YGL258W	621 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YET1	YKL065C	621 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	ECI1	YLR284C	843 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	RPL20A	YMR242C	519 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	ATX1	YNL259C	222 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SUS1	YBR111W-A	291 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SHG1	YBR258C	429 nt		2.92	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	LRG1	YDL240W	3054 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YDR061W	YDR061W	1620 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	GCD6	YDR211W	2139 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SNO3	YFL060C	669 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YIP1	YGR172C	747 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	MVB12	YGR206W	306 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	DSE2	YHR143W	978 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YLL044W	YLL044W	447 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SNO2	YNL334C	669 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YPR147C	YPR147C	915 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	CUR1	YPR158W	759 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	MPS1	YDL028C	2295 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	PSK1	YAL017W	4071 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	ERG11	YHR007C	1593 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	HFD1	YMR110C	1599 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SLF1	YDR515W	1344 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	LST4	YKL176C	2487 nt		2.91	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	RPA190	YOR341W	4995 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	FRE8	YLR047C	2061 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	VPS30	YPL120W	1674 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	RSM24	YDR175C	960 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YDR262W	YDR262W	819 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YHL005C	YHL005C	393 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	AIM26	YKL037W	357 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	ARC18	YLR370C	537 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	DYN3	YMR299C	939 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YNL089C	YNL089C	477 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	LCL1	YPL056C	306 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	CEP3	YMR168C	1827 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	ANR2	YKL047W	1551 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	PSD2	YGR170W	3417 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	SLK19	YOR195W	2466 nt		2.9	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	STE6	YKL209C	3873 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	OPI6	YDL096C	327 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	KEI1	YDR367W	666 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YIP5	YGL161C	933 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YGR226C	YGR226C	210 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	CWC22	YGR278W	1734 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	RPL17B	YJL177W	555 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	MRPL16	YBL038W	699 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	MPP6	YNR024W	561 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YRO2	YBR054W	1035 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	NMD2	YHR077C	3270 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YFL002W-B	YFL002W-B	1317 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YGR161W-A	YGR161W-A	1317 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YBL100W-A	YBL100W-A	1317 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YCL020W	YCL020W	1317 nt		2.89	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	GYL1	YMR192W	2163 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YCT1	YLL055W	1596 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	HBT1	YDL223C	3141 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YCG1	YDR325W	3108 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YDL163W	YDL163W	303 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	MST27	YGL051W	705 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	PCL5	YHR071W	690 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	PRP21	YJL203W	843 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	MST28	YAR033W	705 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	GIM3	YNL153C	390 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	AIM4	YBR194W	372 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	BNI4	YNL233W	2679 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	HFM1	YGL251C	3564 nt		2.88	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	NSA1	YGL111W	1392 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	UTP14	YML093W	2700 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	DIA2	YOR080W	2199 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	YFL012W-A	YFL012W-A	375 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	SAE2	YGL175C	1038 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	THG1	YGR024C	714 nt		2.87	□□□□□ -1.95
DSL1	P53847	RPL11B	YGR085C	525 nt		2.87	□□□□□ -1.95

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