Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTNP21246 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTNP21246 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTNP21246 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTNP21246 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTNP21246 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTNP21246 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTNP21246 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTNP21246 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTNP21246 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTNP21246 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms