Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Rabep1O35551 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rabep1O35551 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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