Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Smad7O35253 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Smad7O35253 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms