Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20425E9Q035 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms