Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brpf1B2RRD7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms