Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms