Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 YWHAZ-222ENST00000523848 664 ntTSL 57.56□□□□□ -1.28e-9■■■□□ 16.2
UTP3Q9NQZ2 ELK4-204ENST00000616704 2535 ntTSL 226.89■■□□□ 1.898e-10■■■□□ 16.2
UTP3Q9NQZ2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.338e-10■■■□□ 16.2
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.595e-7■■■□□ 16.2
UTP3Q9NQZ2 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 28□□□□□ -1.131e-9■■■□□ 16.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-207ENST00000503105 559 ntTSL 318.63■□□□□ 0.575e-7■■■□□ 16.1
UTP3Q9NQZ2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.114e-7■■■□□ 16.1
UTP3Q9NQZ2 VCP-207ENST00000493886 2942 ntTSL 214.84□□□□□ -0.034e-7■■■□□ 16.1
UTP3Q9NQZ2 NCL-205ENST00000453992 964 ntTSL 420.63■□□□□ 0.894e-8■■■□□ 16.1
UTP3Q9NQZ2 NCL-204ENST00000436894 562 ntTSL 47.04□□□□□ -1.284e-8■■■□□ 16.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.95e-7■■■□□ 16.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF207-213ENST00000581531 3560 ntTSL 56.92□□□□□ -1.35e-7■■■□□ 16.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.535e-7■■■□□ 16.1
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-207ENST00000468001 613 ntTSL 319.24■□□□□ 0.673e-6■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 SLC2A1-205ENST00000475162 598 ntTSL 514.91□□□□□ -0.023e-8■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 SNRNP200-206ENST00000484372 581 ntTSL 212.62□□□□□ -0.393e-8■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP19-201ENST00000365186 109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.543e-8■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF3B-208ENST00000466199 734 ntTSL 29.79□□□□□ -0.843e-8■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-226ENST00000461048 1163 ntTSL 1 (best)22.87■■□□□ 1.259e-6■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-207ENST00000525995 592 ntTSL 422.77■■□□□ 1.242e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.869e-6■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.859e-6■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-228ENST00000534246 523 ntTSL 216.93■□□□□ 0.32e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-210ENST00000527419 571 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.099e-6■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-216ENST00000530702 563 ntTSL 214.08□□□□□ -0.162e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-211ENST00000527526 555 ntTSL 413.85□□□□□ -0.192e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-240ENST00000484648 218 ntTSL 312.4□□□□□ -0.429e-6■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-214ENST00000530211 591 ntTSL 212.21□□□□□ -0.452e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-212ENST00000528562 601 ntTSL 412.1□□□□□ -0.472e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 BNIP3L-203ENST00000520077 922 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.499e-6■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-227ENST00000533485 806 ntTSL 211.07□□□□□ -0.642e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-219ENST00000531507 591 ntTSL 510.93□□□□□ -0.662e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-226ENST00000532570 573 ntTSL 510.59□□□□□ -0.712e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.979e-6■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 BNIP3L-205ENST00000521254 502 ntTSL 27.31□□□□□ -1.249e-6■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-206ENST00000525972 584 ntTSL 26.76□□□□□ -1.332e-12■■■□□ 16
UTP3Q9NQZ2 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 215.87■□□□□ 0.137e-8■■■□□ 15.9
UTP3Q9NQZ2 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.387e-8■■■□□ 15.9
UTP3Q9NQZ2 NONO-214ENST00000490044 3215 ntTSL 29.01□□□□□ -0.974e-6■■■□□ 15.9
UTP3Q9NQZ2 HDLBP-231ENST00000467435 639 ntTSL 213.29□□□□□ -0.283e-6■■■□□ 15.8
UTP3Q9NQZ2 TTLL12-203ENST00000484711 2451 ntTSL 216.61■□□□□ 0.254e-7■■■□□ 15.8
UTP3Q9NQZ2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 15.8
UTP3Q9NQZ2 TMED9-204ENST00000507723 1018 ntTSL 215.22■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 15.8
UTP3Q9NQZ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.562e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.332e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 HSPE1-205ENST00000465573 639 ntTSL 220.22■□□□□ 0.832e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 HSPE1-207ENST00000495200 537 ntTSL 319.33■□□□□ 0.682e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 HSPE1-206ENST00000473395 569 ntTSL 214.21□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-235ENST00000583751 177 ntTSL 310.69□□□□□ -0.72e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 VCL-204ENST00000472585 556 ntTSL 29.81□□□□□ -0.842e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 HSPE1-204ENST00000463841 700 ntTSL 28.17□□□□□ -1.12e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-7■■■□□ 15.7
UTP3Q9NQZ2 ASNS-215ENST00000462436 698 ntTSL 213.72□□□□□ -0.216e-8■■■□□ 15.6
UTP3Q9NQZ2 ALDH1A2-224ENST00000561070 554 ntTSL 410.33□□□□□ -0.765e-7■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 ALDH1A2-215ENST00000559266 545 ntTSL 410.27□□□□□ -0.775e-7■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 CPSF1-211ENST00000533492 510 ntTSL 516.4■□□□□ 0.221e-7■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 RPL38-205ENST00000530646 2450 ntTSL 1 (best)19.06■□□□□ 0.644e-10■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 RPL38-203ENST00000528433 169 ntTSL 513.98□□□□□ -0.174e-10■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.254e-10■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.434e-10■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 RPL38-204ENST00000529123 576 ntTSL 211.22□□□□□ -0.614e-10■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 RPL38-207ENST00000534490 429 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.634e-10■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.644e-10■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.674e-10■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 PRKAR2B-203ENST00000488792 609 ntTSL 36.47□□□□□ -1.375e-6■■■□□ 15.5
UTP3Q9NQZ2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.074e-10■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.574e-12■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 CD164-208ENST00000506649 778 ntTSL 322.46■■□□□ 1.191e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 ENO2-210ENST00000539713 543 ntTSL 417.26■□□□□ 0.351e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 516.76■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 ENO2-212ENST00000542509 825 ntTSL 514.95□□□□□ -0.021e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 ENO2-206ENST00000536199 823 ntTSL 514.14□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 ENO2-208ENST00000537838 541 ntTSL 413.87□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-207ENST00000588422 507 ntTSL 213.24□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-205ENST00000586932 667 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.521e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-204ENST00000586513 493 ntTSL 511.55□□□□□ -0.561e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-212ENST00000593062 704 ntTSL 210.2□□□□□ -0.781e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC9.47□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 TRPM7-203ENST00000560284 987 ntTSL 59.11□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-215ENST00000640465 4365 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.651e-6■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.83□□□□□ -1.322e-8■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.459e-10■■■□□ 15.4
UTP3Q9NQZ2 ADAMTSL4-205ENST00000483335 1826 ntTSL 1 (best)17.24■□□□□ 0.352e-6■■■□□ 15.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.985e-9■■■□□ 15.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.875e-9■■■□□ 15.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.125e-9■■■□□ 15.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-203ENST00000590331 422 ntTSL 28.73□□□□□ -1.015e-9■■■□□ 15.3
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.691e-6■■■□□ 15.3
UTP3Q9NQZ2 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-8■■■□□ 15.3
UTP3Q9NQZ2 AARS-206ENST00000569790 528 ntTSL 57.59□□□□□ -1.192e-6■■■□□ 15.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.927e-8■■■□□ 15.2
UTP3Q9NQZ2 NONO-205ENST00000418921 703 ntTSL 510.01□□□□□ -0.814e-11■■■□□ 15.2
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