Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms