Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubl3Q9Z2M6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms