Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1BQ9UPS6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SETD1BQ9UPS6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms