Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col5a3Q9JLI2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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